ନାଟ୍ ମେଡ୍ | କୋଲୋରେକ୍ଟାଲ୍ କର୍କଟ ରୋଗର ସମନ୍ୱିତ ଟ୍ୟୁମର, ଇମ୍ୟୁନିଟି ଏବଂ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ଭୂଦୃଶ୍ୟ ମ୍ୟାପିଂ ପାଇଁ ଏକ ବହୁ-ଓମିକ୍ସ ପଦ୍ଧତି, ଇମ୍ୟୁନିଟି ପ୍ରଣାଳୀ ସହିତ ମାଇକ୍ରୋବାୟୋମର ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟାକୁ ପ୍ରକାଶ କରେ।
ଯଦିଓ ପ୍ରାଥମିକ କୋଲନ କର୍କଟ ପାଇଁ ବାୟୋମାର୍କରଗୁଡ଼ିକୁ ସାମ୍ପ୍ରତିକ ବର୍ଷଗୁଡ଼ିକରେ ବ୍ୟାପକ ଭାବରେ ଅଧ୍ୟୟନ କରାଯାଇଛି, ବର୍ତ୍ତମାନର କ୍ଲିନିକାଲ୍ ନିର୍ଦ୍ଦେଶାବଳୀ ଚିକିତ୍ସା ସୁପାରିଶ ନିର୍ଣ୍ଣୟ କରିବା ପାଇଁ କେବଳ ଟ୍ୟୁମର-ଲିମ୍ଫ ନୋଡ୍-ମେଟାଷ୍ଟାସିସ୍ ପର୍ଯ୍ୟାୟ ଏବଂ ଡିଏନଏ ମିସମେଚ୍ ମରାମତି (MMR) ତ୍ରୁଟି କିମ୍ବା ମାଇକ୍ରୋସାଟେଲାଇଟ୍ ଅସ୍ଥିରତା (MSI) (ମାନକ ପାଥୋଲୋଜି ପରୀକ୍ଷା ବ୍ୟତୀତ) ଚିହ୍ନଟ ଉପରେ ନିର୍ଭର କରେ। ଗବେଷକମାନେ କର୍କଟ ଜିନୋମ୍ ଆଟଲାସ୍ (TCGA) କୋଲୋରେକ୍ଟଲ୍ କର୍କଟ ଗୋଷ୍ଠୀ ଏବଂ ରୋଗୀ ବଞ୍ଚିବାରେ ଜିନ୍ ପ୍ରକାଶନ-ଆଧାରିତ ପ୍ରତିରକ୍ଷା ପ୍ରତିକ୍ରିୟା, ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ ଏବଂ ଟ୍ୟୁମର ଷ୍ଟ୍ରୋମା ମଧ୍ୟରେ ସମ୍ପର୍କର ଅଭାବ ଲକ୍ଷ୍ୟ କରିଛନ୍ତି।
ଗବେଷଣା ଅଗ୍ରଗତି ହେବା ସହିତ, ପ୍ରାଥମିକ କୋଲୋରେକ୍ଟଲ୍ କର୍କଟ ରୋଗର ପରିମାଣାତ୍ମକ ବୈଶିଷ୍ଟ୍ୟଗୁଡ଼ିକ, ଯେଉଁଥିରେ କର୍କଟ ରୋଗର କୋଷୀୟ, ପ୍ରତିରକ୍ଷା, ଷ୍ଟ୍ରୋମାଲ କିମ୍ବା ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ପ୍ରକୃତି ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ, କ୍ଲିନିକାଲ୍ ଫଳାଫଳ ସହିତ ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ ଭାବରେ ସମ୍ପର୍କିତ ହୋଇଥିବା ରିପୋର୍ଟ କରାଯାଇଛି, କିନ୍ତୁ ସେମାନଙ୍କର ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ରୋଗୀ ଫଳାଫଳକୁ କିପରି ପ୍ରଭାବିତ କରେ ସେ ବିଷୟରେ ଏପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ସୀମିତ ବୁଝାମଣା ରହିଛି।
ଫେନୋଟାଇପିକ୍ ଜଟିଳତା ଏବଂ ଫଳାଫଳ ମଧ୍ୟରେ ସମ୍ପର୍କ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରିବା ପାଇଁ, କତାରର ସିଡ୍ରା ଇନଷ୍ଟିଚ୍ୟୁଟ୍ ଅଫ୍ ମେଡିକାଲ୍ ରିସର୍ଚ୍ଚର ଗବେଷକମାନଙ୍କ ଏକ ଦଳ ସମ୍ପ୍ରତି ଏକ ସମନ୍ୱିତ ସ୍କୋର (mICRoScore) ବିକଶିତ ଏବଂ ବୈଧ କରିଛନ୍ତି ଯାହା ମାଇକ୍ରୋବାୟୋମ୍ ବୈଶିଷ୍ଟ୍ୟ ଏବଂ ଇମିନ୍ୟୁ ରିଜେକ୍ସନ୍ ସ୍ଥିରାଙ୍କ (ICR) କୁ ମିଶ୍ରଣ କରି ଭଲ ବଞ୍ଚିବା ହାର ଥିବା ରୋଗୀଙ୍କ ଏକ ଗୋଷ୍ଠୀକୁ ଚିହ୍ନଟ କରେ। ଦଳଟି ପ୍ରାଥମିକ କୋଲୋରେକ୍ଟଲ୍ କର୍କଟ ରୋଗରେ ପୀଡିତ 348 ଜଣ ରୋଗୀଙ୍କଠାରୁ ତାଜା ଫ୍ରୋଜନ୍ ନମୁନାର ଏକ ବ୍ୟାପକ ଜିନୋମିକ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣ କରିଥିଲା, ଯେଉଁଥିରେ ଟ୍ୟୁମର RNA ସିକୋଇନ୍ସିଂ ଏବଂ ମେଳ ଖାଉଥିବା ସୁସ୍ଥ କୋଲୋରେକ୍ଟଲ୍ ଟିସୁ, ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଏକ୍ସୋମ୍ ସିକୋଇନ୍ସିଂ, ଗଭୀର T-କୋଷ ରିସେପ୍ଟର ଏବଂ 16S ବ୍ୟାକ୍ଟେରିଆଲ୍ rRNA ଜିନ୍ ସିକୋଇନ୍ସିଂ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ, ଯାହା ମାଇକ୍ରୋବାୟୋମ୍ କୁ ଆହୁରି ଗୁଣିତ କରିବା ପାଇଁ ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଟ୍ୟୁମର ଜିନୋମ୍ ସିକୋଇନ୍ସିଂ ଦ୍ୱାରା ପରିପୂରକ। ଏହି ଅଧ୍ୟୟନକୁ ନେଚର ମେଡିସିନରେ "ଏକ ସମନ୍ୱିତ ଟ୍ୟୁମର, ଇମିନ୍ୟୁମ୍ ଏବଂ ମାଇକ୍ରୋବାୟୋମ୍ ଆଟଲାସ୍ ଅଫ୍ କୋଲନ୍ କ୍ୟାନସର" ଭାବରେ ପ୍ରକାଶିତ କରାଯାଇଥିଲା।
ପ୍ରକୃତି ଚିକିତ୍ସାରେ ପ୍ରକାଶିତ ଆର୍ଟିକିଲ୍
AC-ICAM ସଂକ୍ଷିପ୍ତ ବିବରଣୀ
ଗବେଷକମାନେ ଏକ ଅର୍ଥୋଗୋନାଲ ଜିନୋମିକ୍ ପ୍ଲାଟଫର୍ମ ବ୍ୟବହାର କରି ତାଜା ଫ୍ରିଜ୍ ହୋଇଥିବା ଟ୍ୟୁମର ନମୁନା ବିଶ୍ଳେଷଣ କରିଥିଲେ ଏବଂ ସିଷ୍ଟମିକ୍ ଥେରାପି ବିନା କୋଲନ କର୍କଟ ରୋଗର ହିଷ୍ଟୋଲୋଜିକ୍ ନିର୍ଣ୍ଣୟ ସହିତ ରୋଗୀଙ୍କଠାରୁ ନିକଟବର୍ତ୍ତୀ ସୁସ୍ଥ କୋଲନ ଟିସୁ (ଟ୍ୟୁମର-ସାଧାରଣ ଯୋଡ଼ି) ମେଳ କରିଥିଲେ। ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ-ଏକ୍ସୋମ୍ ସିକୋଇନ୍ସିଂ (WES), RNA-seq ଡାଟା ଗୁଣବତ୍ତା ନିୟନ୍ତ୍ରଣ ଏବଂ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତି ମାନଦଣ୍ଡ ସ୍କ୍ରିନିଂ ଉପରେ ଆଧାର କରି, 348 ରୋଗୀଙ୍କଠାରୁ ଜିନୋମିକ୍ ତଥ୍ୟ ରଖାଯାଇଥିଲା ଏବଂ 4.6 ବର୍ଷର ମଧ୍ୟମ ଅନୁସରଣ ସହିତ ଡାଉନଷ୍ଟ୍ରିମ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣ ପାଇଁ ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇଥିଲା। ଗବେଷଣା ଦଳ ଏହି ଉତ୍ସକୁ Sidra-LUMC AC-ICAM ନାମ ଦେଇଥିଲେ: ପ୍ରତିରକ୍ଷା-କର୍କଟ-ମାଇକ୍ରୋବାଇଓମ୍ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ପାଇଁ ଏକ ମାନଚିତ୍ର ଏବଂ ମାର୍ଗଦର୍ଶିକା (ଚିତ୍ର 1)।
ICR ବ୍ୟବହାର କରି ଆଣବିକ ବର୍ଗୀକରଣ
ନିରନ୍ତର କର୍କଟ ରୋଗ ପ୍ରତିରୋଧକତା ପାଇଁ ଇମ୍ମ୍ୟୁନ ଜେନେଟିକ୍ ମାର୍କରଗୁଡ଼ିକର ଏକ ମଡ୍ୟୁଲାର୍ ସେଟ୍ କ୍ୟାପଚର୍ କରି, ଯାହାକୁ ଇମ୍ମ୍ୟୁନ କନଷ୍ଟାଣ୍ଟ ଅଫ୍ ରିଜେକ୍ସନ୍ (ICR) କୁହାଯାଏ, ଗବେଷଣା ଦଳ ICRକୁ ମେଲାନୋମା, ମୂତ୍ରାଶୟ କର୍କଟ ଏବଂ ସ୍ତନ କର୍କଟ ସମେତ ବିଭିନ୍ନ ପ୍ରକାରର କର୍କଟ ରୋଗକୁ କଭର କରୁଥିବା ଏକ 20-ଜିନ୍ ପ୍ୟାନେଲରେ ଘନୀଭୂତ କରି ଏହାକୁ ଅପ୍ଟିମାଇଜ୍ କରିଛନ୍ତି। ICR କୁ ସ୍ତନ କର୍କଟ ସମେତ ବିଭିନ୍ନ ପ୍ରକାରର କର୍କଟ ରୋଗରେ ଇମ୍ମ୍ୟୁନୋଥେରାପି ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ସହିତ ମଧ୍ୟ ଜଡିତ କରାଯାଇଛି।
ପ୍ରଥମେ, ଗବେଷକମାନେ AC-ICAM କୋହର୍ଟର ICR ସ୍ୱାକ୍ଷରକୁ ବୈଧ କରିଥିଲେ, ICR ଜିନ୍-ଆଧାରିତ ସହ-ବର୍ଗୀକରଣ ପଦ୍ଧତି ବ୍ୟବହାର କରି କୋହର୍ଟକୁ ତିନୋଟି କ୍ଲଷ୍ଟର/ପ୍ରତିରକ୍ଷା ଉପପ୍ରକାରରେ ବର୍ଗୀକୃତ କରିଥିଲେ: ଉଚ୍ଚ ICR (ଗରମ ଟ୍ୟୁମର), ମଧ୍ୟମ ICR ଏବଂ ନିମ୍ନ ICR (ଥଣ୍ଡା ଟ୍ୟୁମର) (ଚିତ୍ର 1b)। ଗବେଷକମାନେ କୋଲନ କର୍କଟ ରୋଗର ଏକ ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପ୍ଟୋମ-ଆଧାରିତ ବର୍ଗୀକରଣ, ସହମତି ଆଣବିକ ଉପପ୍ରକାର (CMS) ସହିତ ଜଡିତ ପ୍ରତିରକ୍ଷା ପ୍ରବୃତ୍ତିକୁ ବର୍ଣ୍ଣିତ କରିଥିଲେ। CMS ବର୍ଗଗୁଡ଼ିକରେ CMS1/ପ୍ରତିରକ୍ଷା, CMS2/କାନୋନିକାଲ୍, CMS3/ମେଟାବୋଲିକ୍ ଏବଂ CMS4/ମେସେନକାଇମାଲ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ ଥିଲା। ବିଶ୍ଳେଷଣରୁ ଜଣାପଡିଛି ଯେ ICR ସ୍କୋର ସମସ୍ତ CMS ଉପପ୍ରକାରରେ କିଛି କର୍କଟ କୋଷ ପଥ ସହିତ ନକାରାତ୍ମକ ଭାବରେ ସମ୍ପର୍କିତ ଥିଲା, ଏବଂ ଇମ୍ୟୁନୋସପ୍ରେସିଭ୍ ଏବଂ ଷ୍ଟ୍ରୋମାଲ-ସମ୍ବନ୍ଧୀୟ ପଥ ସହିତ ସକାରାତ୍ମକ ସମ୍ପର୍କ କେବଳ CMS4 ଟ୍ୟୁମରରେ ପରିଲକ୍ଷିତ ହୋଇଥିଲା।
ସମସ୍ତ CMS ରେ, ICR ଉଚ୍ଚ ପ୍ରତିରକ୍ଷା ଉପପ୍ରକାରରେ ପ୍ରାକୃତିକ ଘାତକ (NK) କୋଷ ଏବଂ T କୋଷ ଉପପ୍ରକାରର ପ୍ରଚୁରତା ସର୍ବାଧିକ ଥିଲା, ଅନ୍ୟ ଲ୍ୟୁକୋସାଇଟ୍ ଉପପ୍ରକାରରେ ଅଧିକ ପରିବର୍ତ୍ତନଶୀଳତା ସହିତ (ଚିତ୍ର 1c)। ICR ପ୍ରତିରକ୍ଷା ଉପପ୍ରକାରରେ ଭିନ୍ନ OS ଏବଂ PFS ଥିଲା, ICR ରେ ନିମ୍ନରୁ ଉଚ୍ଚକୁ କ୍ରମାଗତ ବୃଦ୍ଧି ସହିତ (ଚିତ୍ର 1d), କୋଲୋରେକ୍ଟଲ୍ କର୍କଟ ରୋଗରେ ICR ର ପୂର୍ବାନୁମାନ ଭୂମିକାକୁ ବୈଧ କରିଥିଲା।
ଚିତ୍ର 1. AC-ICAM ଅଧ୍ୟୟନ ଡିଜାଇନ୍, ରୋଗ ପ୍ରତିରୋଧକ ଶକ୍ତି-ସମ୍ବନ୍ଧୀୟ ଜିନ୍ ସ୍ୱାକ୍ଷର, ରୋଗ ପ୍ରତିରୋଧକ ଶକ୍ତି ଏବଂ ଆଣବିକ ଉପପ୍ରକାର ଏବଂ ବଞ୍ଚିବା।
ICR ଟ୍ୟୁମର-ସୃଦ୍ଧ, କ୍ଲୋନାଲି ପ୍ରଶସ୍ତ T କୋଷଗୁଡ଼ିକୁ କ୍ୟାପଚର କରେ
ଟ୍ୟୁମର ଟିସୁରେ ଅନୁପ୍ରବେଶ କରୁଥିବା ଟି କୋଷଗୁଡ଼ିକର କେବଳ ଏକ ସଂଖ୍ୟାଲଘୁ ଟ୍ୟୁମର ଆଣ୍ଟିଜେନ ପାଇଁ ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ ବୋଲି ରିପୋର୍ଟ କରାଯାଇଛି (୧୦% ରୁ କମ୍)। ତେଣୁ, ଅଧିକାଂଶ ଆନ୍ତଃ-ଟ୍ୟୁମର ଟି କୋଷକୁ ବାଇଷ୍ଟାଣ୍ଡର ଟି କୋଷ (ବାଇଷ୍ଟାଣ୍ଡର ଟି କୋଷ) କୁହାଯାଏ। ଉତ୍ପାଦନକ୍ଷମ ଟିସିଆର ସହିତ ପାରମ୍ପରିକ ଟି କୋଷ ସଂଖ୍ୟା ସହିତ ସବୁଠାରୁ ଦୃଢ଼ ସମ୍ପର୍କ ଷ୍ଟ୍ରୋମାଲ କୋଷ ଏବଂ ଲ୍ୟୁକୋସାଇଟ୍ ଉପଜନସଂଖ୍ୟା (RNA-seq ଦ୍ୱାରା ଚିହ୍ନଟ) ରେ ପରିଲକ୍ଷିତ ହୋଇଥିଲା, ଯାହାକୁ T କୋଷ ଉପଜନସଂଖ୍ୟା ଆକଳନ କରିବାକୁ ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇପାରିବ (ଚିତ୍ର 2a)। ICR କ୍ଲଷ୍ଟର (ସାମଗ୍ର ଏବଂ CMS ବର୍ଗୀକରଣ) ରେ, ICR-ଉଚ୍ଚ ଏବଂ CMS ଉପପ୍ରକାର CMS1/ପ୍ରତିରକ୍ଷା ଗୋଷ୍ଠୀ (ଚିତ୍ର 2c) ରେ ପ୍ରତିରକ୍ଷା SEQ TCR ର ସର୍ବାଧିକ କ୍ଲୋନାଲିଟି ପରିଲକ୍ଷିତ ହୋଇଥିଲା, ICR-ଉଚ୍ଚ ଟ୍ୟୁମରର ସର୍ବାଧିକ ଅନୁପାତ ସହିତ। ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଟ୍ରାନ୍ସକ୍ରିପ୍ଟୋମ (୧୮,୨୭୦ ଜିନ୍) ବ୍ୟବହାର କରି, ଛଅଟି ICR ଜିନ୍ (IFNG, STAT1, IRF1, CCL5, GZMA, ଏବଂ CXCL10) TCR ଇମ୍ୟୁନ SEQ କ୍ଲୋନାଲିଟି ସହିତ ସକାରାତ୍ମକ ଭାବରେ ଜଡିତ ଶ୍ରେଷ୍ଠ ଦଶଟି ଜିନ୍ ମଧ୍ୟରେ ଥିଲା (ଚିତ୍ର 2d)। ଇମ୍ୟୁନୋSEQ TCR କ୍ଲୋନାଲିଟି ଟ୍ୟୁମର-ପ୍ରତିକ୍ରିୟାଶୀଳ CD8+ ମାର୍କର (ଚିତ୍ର 2f ଏବଂ 2g) ବ୍ୟବହାର କରି ପର୍ଯ୍ୟବେକ୍ଷିତ ସହସଂଯୋଗ ଅପେକ୍ଷା ଅଧିକାଂଶ ICR ଜିନ୍ ସହିତ ଅଧିକ ଦୃଢ଼ ଭାବରେ ସମ୍ପର୍କିତ ଥିଲା। ଶେଷରେ, ଉପରୋକ୍ତ ବିଶ୍ଳେଷଣ ସୂଚାଇ ଦିଏ ଯେ ICR ସ୍ୱାକ୍ଷର ଟ୍ୟୁମର-ସମୃଦ୍ଧ, କ୍ଲୋନାଲି ପ୍ରବର୍ଦ୍ଧିତ T କୋଷଗୁଡ଼ିକର ଉପସ୍ଥିତିକୁ କ୍ୟାପଚର କରେ ଏବଂ ଏହାର ପୂର୍ବାନୁମାନ ପ୍ରଭାବ ବ୍ୟାଖ୍ୟା କରିପାରେ।
ଚିତ୍ର 2. ପ୍ରତିରକ୍ଷା ସମ୍ବନ୍ଧୀୟ ଜିନ୍, ପ୍ରତିରକ୍ଷା ଏବଂ ଆଣବିକ ଉପପ୍ରକାର ସହିତ TCR ମେଟ୍ରିକ୍ସ ଏବଂ ସମ୍ପର୍କ।
ସୁସ୍ଥ ଏବଂ କୋଲନ କର୍କଟ ଟିସୁରେ ମାଇକ୍ରୋବାଇଓମ୍ ରଚନା
ଗବେଷକମାନେ ୨୪୬ ଜଣ ରୋଗୀଙ୍କ ଠାରୁ ମେଳ ଖାଉଥିବା ଟ୍ୟୁମର ଏବଂ ସୁସ୍ଥ କୋଲନ ଟିସୁରୁ ବାହାର କରାଯାଇଥିବା DNA ବ୍ୟବହାର କରି ୧୬S rRNA ସିକୋଇନ୍ସିଂ କରିଥିଲେ (ଚିତ୍ର ୩a)। ବୈଧତା ପାଇଁ, ଗବେଷକମାନେ ଅତିରିକ୍ତ ୪୨ ଟି ଟ୍ୟୁମର ନମୁନାରୁ ୧୬S rRNA ଜିନ୍ ସିକୋଇନ୍ସିଂ ଡାଟା ବିଶ୍ଳେଷଣ କରିଥିଲେ ଯାହା ବିଶ୍ଳେଷଣ ପାଇଁ ଉପଲବ୍ଧ ସାଧାରଣ DNA ସହିତ ମେଳ ଖାଉଥିବା ନଥିଲା। ପ୍ରଥମେ, ଗବେଷକମାନେ ମେଳ ଖାଉଥିବା ଟ୍ୟୁମର ଏବଂ ସୁସ୍ଥ କୋଲନ ଟିସୁ ମଧ୍ୟରେ ଉଦ୍ଭିଦର ଆପେକ୍ଷିକ ପ୍ରଚୁରତା ତୁଳନା କରିଥିଲେ। ସୁସ୍ଥ ନମୁନା ତୁଳନାରେ ଟ୍ୟୁମରରେ କ୍ଲୋଷ୍ଟ୍ରିଡିୟମ୍ ପର୍ଫ୍ରିଞ୍ଜେନ୍ସ ଯଥେଷ୍ଟ ବୃଦ୍ଧି ପାଇଥିଲା (ଚିତ୍ର ୩a-୩d)। ଟ୍ୟୁମର ଏବଂ ସୁସ୍ଥ ନମୁନା ମଧ୍ୟରେ ଆଲଫା ବିବିଧତା (ଗୋଟିଏ ନମୁନାରେ ପ୍ରଜାତିର ବିବିଧତା ଏବଂ ପ୍ରଚୁରତା) ରେ କୌଣସି ଗୁରୁତ୍ୱପୂର୍ଣ୍ଣ ପାର୍ଥକ୍ୟ ନଥିଲା, ଏବଂ ICR-କମ୍ ଟ୍ୟୁମର ତୁଳନାରେ ICR-ଉଚ୍ଚ ଟ୍ୟୁମରରେ ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ବିବିଧତାରେ ଏକ ସାମାନ୍ୟ ହ୍ରାସ ପରିଲକ୍ଷିତ ହୋଇଥିଲା।
ମାଇକ୍ରୋବାୟଲ୍ ପ୍ରୋଫାଇଲ୍ ଏବଂ କ୍ଲିନିକାଲ୍ ଫଳାଫଳ ମଧ୍ୟରେ କ୍ଲିନିକାଲ୍ ପ୍ରାସଙ୍ଗିକ ସମ୍ପର୍କ ଚିହ୍ନଟ କରିବା ପାଇଁ, ଗବେଷକମାନେ ବଞ୍ଚିବାର ପୂର୍ବାନୁମାନ କରୁଥିବା ମାଇକ୍ରୋବାୟୋମ୍ ବୈଶିଷ୍ଟ୍ୟଗୁଡ଼ିକୁ ଚିହ୍ନଟ କରିବା ପାଇଁ 16S rRNA ଜିନ୍ ସିକୋଇନ୍ସିଂ ଡାଟା ବ୍ୟବହାର କରିବାକୁ ଲକ୍ଷ୍ୟ ରଖିଥିଲେ। AC-ICAM246 ରେ, ଗବେଷକମାନେ ଏକ OS Cox ରିଗ୍ରେସନ୍ ମଡେଲ୍ ଚଲାଇଥିଲେ ଯାହା ଅଣ-ଶୂନ୍ୟ ଗୁଣାଙ୍କ (ବିଭେଦକ ମୃତ୍ୟୁ ବିପଦ ସହିତ ଜଡିତ) ସହିତ 41 ବୈଶିଷ୍ଟ୍ୟଗୁଡ଼ିକୁ ଚୟନ କରିଥିଲା, ଯାହାକୁ MBR କ୍ଲାସିଫାୟର୍ (ଚିତ୍ର 3f) କୁହାଯାଏ।
ଏହି ତାଲିମ ଗୋଷ୍ଠୀ (ICAM246) ରେ, ଏକ କମ୍ MBR ସ୍କୋର (MBR<0, କମ୍ MBR) ମୃତ୍ୟୁର ଯଥେଷ୍ଟ କମ୍ ବିପଦ (85%) ସହିତ ଜଡିତ ଥିଲା। ଗବେଷକମାନେ ଦୁଇଟି ସ୍ୱାଧୀନ ଭାବରେ ବୈଧ ଗୋଷ୍ଠୀ (ICAM42 ଏବଂ TCGA-COAD) ରେ କମ୍ MBR (ବିପଦ) ଏବଂ ଦୀର୍ଘକାଳୀନ OS ମଧ୍ୟରେ ସମ୍ପର୍କକୁ ନିଶ୍ଚିତ କରିଥିଲେ। (ଚିତ୍ର 3) ଅଧ୍ୟୟନଟି ଏଣ୍ଡୋଗ୍ୟାଷ୍ଟ୍ରିକ୍ କୋକି ଏବଂ MBR ସ୍କୋର ମଧ୍ୟରେ ଏକ ଦୃଢ଼ ସମ୍ପର୍କ ଦେଖାଇଥିଲା, ଯାହା ଟ୍ୟୁମର ଏବଂ ସୁସ୍ଥ କୋଲନ ଟିସୁରେ ସମାନ ଥିଲା।
ଚିତ୍ର 3. ଟ୍ୟୁମର ଏବଂ ସୁସ୍ଥ ଟିସୁରେ ମାଇକ୍ରୋବାଇଓମ୍ ଏବଂ ICR ଏବଂ ରୋଗୀଙ୍କ ବଞ୍ଚିବା ସହିତ ସମ୍ପର୍କ।
ଉପସଂହାର
ଏହି ଅଧ୍ୟୟନରେ ବ୍ୟବହୃତ ମଲ୍ଟି-ଓମିକ୍ସ ପଦ୍ଧତି କୋଲୋରେକ୍ଟଲ୍ କର୍କଟ ରୋଗରେ ପ୍ରତିରକ୍ଷା ପ୍ରତିକ୍ରିୟାର ଆଣବିକ ସ୍ୱାକ୍ଷରର ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଚିହ୍ନଟ ଏବଂ ବିଶ୍ଳେଷଣକୁ ସକ୍ଷମ କରିଥାଏ ଏବଂ ମାଇକ୍ରୋବାଇଓମ୍ ଏବଂ ପ୍ରତିରକ୍ଷା ପ୍ରଣାଳୀ ମଧ୍ୟରେ ପାରସ୍ପରିକ କ୍ରିୟା ପ୍ରକାଶ କରିଥାଏ। ଟ୍ୟୁମର ଏବଂ ସୁସ୍ଥ ଟିସୁଗୁଡ଼ିକର ଗଭୀର TCR କ୍ରମ ପ୍ରକାଶ କରିଛି ଯେ ICRର ପୂର୍ବାନୁମାନ ପ୍ରଭାବ ଟ୍ୟୁମର-ସମୃଦ୍ଧ ଏବଂ ସମ୍ଭବତଃ ଟ୍ୟୁମର ଆଣ୍ଟିଜେନ-ନିର୍ଦ୍ଦିଷ୍ଟ T କୋଷ କ୍ଲୋନଗୁଡ଼ିକୁ କ୍ୟାପଚର କରିବାର କ୍ଷମତା ହେତୁ ହୋଇପାରେ।
AC-ICAM ନମୁନାରେ 16S rRNA ଜିନ୍ ସିକୋଏନ୍ସିଂ ବ୍ୟବହାର କରି ଟ୍ୟୁମର ମାଇକ୍ରୋବାୟୋମ୍ ରଚନା ବିଶ୍ଳେଷଣ କରି, ଦଳ ଏକ ଦୃଢ଼ ପୂର୍ବାନୁମାନ ମୂଲ୍ୟ ସହିତ ଏକ ମାଇକ୍ରୋବାୟୋମ୍ ସିଗନେଚର (MBR ବିପଦ ସ୍କୋର) ଚିହ୍ନଟ କରିଥିଲେ। ଯଦିଓ ଏହି ସିଗନେଚର ଟ୍ୟୁମର ନମୁନାରୁ ପ୍ରାପ୍ତ ହୋଇଥିଲା, ସୁସ୍ଥ କୋଲୋରେକ୍ଟମ୍ ଏବଂ ଟ୍ୟୁମର MBR ବିପଦ ସ୍କୋର ମଧ୍ୟରେ ଏକ ଦୃଢ଼ ସମ୍ପର୍କ ଥିଲା, ଯାହା ସୂଚାଇ ଦେଉଛି ଯେ ଏହି ସିଗନେଚର ରୋଗୀଙ୍କ ଅନ୍ତନଳୀ ମାଇକ୍ରୋବାୟୋମ୍ ରଚନାକୁ କ୍ୟାପଚର କରିପାରେ। ICR ଏବଂ MBR ସ୍କୋରକୁ ମିଶ୍ରଣ କରି, ଏକ ମଲ୍ଟି-ଓମିକ୍ ଛାତ୍ର ବାୟୋମାର୍କରକୁ ଚିହ୍ନଟ ଏବଂ ବୈଧ କରିବା ସମ୍ଭବ ହୋଇଥିଲା ଯାହା କୋଲନ୍ କର୍କଟ ରୋଗୀଙ୍କ ବଞ୍ଚିବାର ପୂର୍ବାନୁମାନ କରେ। ଅଧ୍ୟୟନର ମଲ୍ଟି-ଓମିକ୍ ଡାଟାସେଟ୍ କୋଲନ୍ କର୍କଟ ଜୀବବିଜ୍ଞାନକୁ ଭଲ ଭାବରେ ବୁଝିବା ଏବଂ ବ୍ୟକ୍ତିଗତ ଚିକିତ୍ସା ପଦ୍ଧତି ଆବିଷ୍କାର କରିବାରେ ସାହାଯ୍ୟ କରିବା ପାଇଁ ଏକ ସମ୍ବଳ ପ୍ରଦାନ କରେ।
ପୋଷ୍ଟ ସମୟ: ଜୁନ୍-୧୫-୨୦୨୩